Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms