Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF541Q9H0D2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF541Q9H0D2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF541Q9H0D2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms