Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD1Q9GZZ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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