Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms