Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRRTQ9BXP5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRTQ9BXP5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms