Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKNK1Q9BUB5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKNK1Q9BUB5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKNK1Q9BUB5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKNK1Q9BUB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKNK1Q9BUB5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms