Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C16orf70Q9BSU1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C16orf70Q9BSU1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms