Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MESP1Q9BRJ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms