Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPIN3Q9BQK8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms