Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms