Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms