Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT140Q96RY7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT140Q96RY7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT140Q96RY7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT140Q96RY7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT140Q96RY7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT140Q96RY7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms