Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMG1Q96Q15 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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