Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU8

KREMEN1, Kremen protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KREMEN1Q96MU8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KREMEN1Q96MU8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KREMEN1Q96MU8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KREMEN1Q96MU8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KREMEN1Q96MU8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms