Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF560Q96MR9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms