Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHACTR3Q96KR7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms