Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERAC1Q96JX3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERAC1Q96JX3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms