Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms