Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms