Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms