Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEURL3Q96EH8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEURL3Q96EH8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms