Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms