Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FBXO17Q96EF6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FBXO17Q96EF6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms