Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PABPC5Q96DU9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms