Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms