Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC127Q96BQ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms