Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFKQ969G6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms