Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms