Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOPBP1Q92547 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOPBP1Q92547 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms