Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCG3Q8WXD2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCG3Q8WXD2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms