Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMO7Q8WWI1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO7Q8WWI1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms