Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
APOBEC4Q8WW27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms