Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH3Q8TE77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH3Q8TE77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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