Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNPRQ8TBG9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNPRQ8TBG9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms