Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO3Q8TAP4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO3Q8TAP4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms