Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC148Q8NFR7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC148Q8NFR7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms