Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC150Q8NCX0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC150Q8NCX0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms