Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC00116Q8NCU8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00116Q8NCU8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms