Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDPRQ8NCN5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDPRQ8NCN5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms