Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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