Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms