Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PROM2Q8N271 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PROM2Q8N271 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms