Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED8Q8IZ13 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED8Q8IZ13 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms