Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms