Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF2Q8IX21 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms