Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC83Q8IWF9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms