Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC50Q8IVM0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC50Q8IVM0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms