Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A9Q8IVB4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms