Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB11FIP4Q86YS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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