Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM25Q86YD3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM25Q86YD3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms